1、積極影晌
(1)跨流域調(diào)水工程會解決“調(diào)水地區(qū)”易遭洪水威脅的災害問題，挽救地區(qū)性生態(tài)危機。如：原蘇聯(lián)的北水南調(diào)等工程除工農(nóng)業(yè)用水之外，還可緩解里海水位下降而引起的生態(tài)環(huán)境惡化。我國的南水北調(diào)工程，將會很好地緩解因南澇北旱所帶來的生態(tài)環(huán)境惡化問題。
(2)大型蓄水庫如我國的黃河小浪底工程既能防沙除澇，又能增加庫區(qū)空氣濕度，改善其周圍綠色植被的生長。如前蘇聯(lián)的中亞和哈薩克的沙漠，由于調(diào)入了大量的水，部分地區(qū)已變成繁茂的綠洲。
(3)優(yōu)化水質(zhì)，減少水污染和下游河道的泥沙淤積。
2、消極影響
(1)爝發(fā)地震。由于大量水體的聚集，會使庫區(qū)地殼結(jié)構(gòu)的地應力發(fā)生變化，為誘發(fā)地震創(chuàng)造條件。
(2)輸水渠道兩岸由于滲漏，使地下水位抬高，造成大面積土壤次生鹽堿化、沼澤化。高邊坡地區(qū)還會因土壤含水過高而引起滑坡或泥石流。
(3)對調(diào)出水地區(qū)生態(tài)也有不利影響。如原蘇聯(lián)的北水南調(diào)工程造成原流入喀拉海的淡水量和熱量減少，西伯利亞大片森林遭破壞，風速加大、春雨減少、秋雨驟增，嚴重影響農(nóng)業(yè)生態(tài)環(huán)境。
(4)打破了原有水系內(nèi)生物(尤其是珍奇動物)的生活環(huán)境，嚴重的會造成滅絕，或打破了原有的生態(tài)平衡系統(tǒng)，使食物鏈遭到破壞，可能引起瘟疫等災難。如三峽庫區(qū)的猿猴，據(jù)專家預測，到三峽大壩建成后，會有相當數(shù)量猿猴流離失所，再也沒有“兩岸猿聲啼不住，輕舟已過萬重山”的盛景了。
(5)對生物、水文、水溫等其它不利影響。大型水利工程改變了原有水文條件，影響了地下水質(zhì)和水溫，造成居民的遷徙、集中，加快城市擴展，導致可用耕地日趨減少。